Ingatlan értékesités ÁFA megítélése

Tisztelt Szakértők! Szeretném a segítségüket kérni abban, hogy van kft., aki 2012. november 13-án egy üzemcsarnokot, áfamentesen, mert az eladó nem jelentkezett be adózóvá tételre. Ezt az üzemcsarnokot (tulajdoni lapja alapján is az) a vásárlás után felújították és az felújítás számláiban felszámolt levonható áfát pedig levonták. Továbbá minden hozzá kapcsolódó számla áfa tartalmát levonták (javítás, karbantartás, rezsiszámlák). Az üzemcsarnokot nem adták bérbe. Most viszont lenne rá vevő, de a kft. tulajdonosa az ingatlan értékesítést nem akarja adózóvá tenni. Kérdésem az lenne, hogy az ingatlant áfamentesen lehet-e értékesíteni? A hozzá kapcsolódó tevékenységek számláiból levont áfával mi lesz? Vissza kellene fizetni a NAV-nak? Köszönettel: Szabó Edina