Kezdődő önállósodás - önálló tevékenység?

Jelenleg munkaviszonyom van, ez mellett otthon műszereket is építgetek, amelyek (internetes) eladásából szert tudnék tenni egy kis mellékesre is. Az általam készített vagy a közeljövőben készítendő eszközök kelendőek, de addig nem akarom folytatni, amíg adóügyi szempontból nem tudom rendezni. Jövőre(2013) kb. 1 millió forintos bruttó (éves) bevétellel számolok így muszáj valami ésszerű és tiszta megoldást találni. Erre az önálló tevékenységre jelenlegi tudomásom szerint adószámot és alanyi áfamentességet kell kérni, és választhatok a 10%-os költségátalány vagy a tételes elszámolás között. Természetesen ez utóbbit választanám, mivel az elszámolható költségekkel kb. 40%-os költséghányadom lesz. Az üzletszerűség is egyértelmű. Itt az a kérdés - és sajnos a cikkek nem foglalkoznak vele - hogy mi történik azzal a 60%-al? Hogyan adózik? Számlaadási kötelezettségem lesz? Ha igen, ezzel a számlával egy "rendes" cégnél el lehet számolni? Könyvelő vagy egyéb költségeim is felmerülhetnek? Pár kiegészítés: a munkahelyi keresetemmel együtt az így nyert bruttó jövedelmem (személyi jövedelem adóalap) így sem fogja elérni a 2 millió 400 ezer forintot. Gépkocsival is rendelkezem, leírható ennek használata - hacsak részlegesen is - kiadásként?